和傳統綠化相比，屋頂綠化與大地隔離，屋頂綠化工程所種植的植物所需水分完全依靠自然降水和人工澆灌，又由于建筑環境的局限，屋頂綠化工程種植土層的厚度不大，而且植物的生長環境較惡劣。所以屋頂綠化工程施工過程中的植物選擇難度較大，選擇植物時既需注意植物生長所需的土層厚度，滿足生長要求，又需要考慮到植物配置技術，所以，屋頂綠化工程植物種植的選擇必須考慮以下幾點：
1.光照
屋頂接受到的太陽輻射較多，紫外線強度較大，因此應選擇喜陽植物或沙生類植物，如景天類，而封閉式屋頂(四周高，中間低)綠化被包圍于眾多建筑物之中，受陽光輻射較少甚至無陽光照射，這種情況下的屋頂綠化工程應選擇喜陰植物。
2.溫度
一般情況下的屋頂位置較高，日照輻射強，樓板等屋面材料升溫較快，降溫也快，屋頂晝夜溫差較大，有利于植物有機物質積累，所以對植物凍害侵害較小。
3.濕度
由于地勢高，日照充足，溫度高，風大及屋頂種植層土層有限，所以水分蒸發較快，種植層濕度相對較低，所以，屋頂水分因素對植物選擇有較高要求。
4.風力及土壤
由于屋頂的遮擋物較少，所以應盡量選擇低矮、抗風力強的植物；屋頂綠化工程的種植土一般由人工合成的輕型基質，土層較薄，因此對于植物養分及水分的吸收有一定限制。
因此，在屋頂綠化工程植物種植的選擇上應多以低矮的灌木和草本植物為主，配合低矮灌木、草坪、地被和攀緣植物，選擇時應根據當地氣候情況，選擇抗旱、抗寒、耐高溫、抗強風、耐瘠薄等抗逆性較強的鄉土植物且盡量做到選擇常綠且冬季可以露地越冬的植物進行栽植；應以小喬木、低灌木、草坪、地被和攀緣為主，來降低屋頂承受能力和防水費用；選擇移植易成活，耐修剪、生長緩慢的植物及養護管理要求較低，費用較低的植物；選擇可以吸收污染的環保植物。
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